植物资源

琅琊山地处亚热带北部边缘和暖温带的南端，是南北植被类型的过渡地带。现已识别出植物有153科，其中乔灌木58科；植物类名贵中药140科803种，号称“天然药圃”，珍贵树木如琅琊榆、醉翁榆是琅琊山风景区的特有树种，主干大者高28米，胸径80厘米，屹立于寺庙周围。景区林地植被为天然次生林和人工林、针叶林和阔叶林相互交错呈块状、带状混交体系。醉翁亭、琅琊寺一带连绵数公里分布有天然次生林，是中国北亚热带向暖温带过渡地带石灰岩地区保存最完整的天然次生林。混交的树种繁多，各具特色，有很高的观赏和科研价值。

动物资源

主要动物有獐、狸猫、狐狸、狗獾、狼等。珍禽益鸟仍然很多，据初步查明，琅琊山拥有鸟类162种，其中属于中日候鸟保护协定中的有54种，白肩雕属于国家三类保护动物，黑枕黄鹂、杜鹃、寿带、灰喜鹊、柳莺、金腰燕、伯劳等都是安徽省著名益鸟。琅琊山上具有生态、经济、科研、观赏价值的鸟类还有：绿头鸭、绿翅鸭、苍鹭、池鹭、大白鹭、中白鹭、夜鹭、牛背鹭、环颈雉、鹰、鹞等。